Sei mesi dopo gli eventi del secondo capitolo di Trails in the Sky, Liberl è tornato in pace, ma anche durante i periodi di pace, ci sono molti illustri e fortunati che bruciano di avidità grazie all'influenza di antichi manufatti. La maggior parte della popolazione rimane all'oscuro dei propri abusi di potere, ma per l'ordine più enigmatico dell'amata Chiesa Septiana, i Gralsritter, spegnere questi aspiranti criminali e rivendicare manufatti a loro nome è quotidiano come professare la propria fede nella Dea .
Alla vigilia di un'altra missione completata con successo, padre Kevin Graham, membro di alto rango, viene immediatamente incaricato di recuperare un altro manufatto che riposa sotto la cattedrale di Grancel. Inoltre, anche se questo è un compito che potrebbe facilmente completare da solo, deve farlo con riluttanza in collaborazione con la sua nuova recluta, la recluta Gralsritter e l'amica d'infanzia Sister Ries Argent.
Inizia così l'inizio di una missione di routine che diventa tutt'altro che, scavando in un nuovo e misterioso regno che segue una serie di regole innaturalmente rigide: Phantasma. Lì, la storia della Chiesa Settiana e il passato dei molti volti familiari che hanno preso le armi per il futuro di Liberl saranno messi a nudo... e alcuni avrebbero fatto meglio a rimanere per sempre sigillati a porte chiuse.
